Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPINO95295 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms