Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM37O94972 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM37O94972 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms