Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATG12O94817 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG12O94817 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG12O94817 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG12O94817 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG12O94817 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG12O94817 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG12O94817 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG12O94817 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATG12O94817 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATG12O94817 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms