Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
IGSF3O75054 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGSF3O75054 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms