Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHX16O60231 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHX16O60231 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHX16O60231 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHX16O60231 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHX16O60231 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DHX16O60231 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
DHX16O60231 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHX16O60231 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHX16O60231 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DHX16O60231 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms