Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA2O43921 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms