Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APAF1O14727 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APAF1O14727 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APAF1O14727 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APAF1O14727 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APAF1O14727 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APAF1O14727 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APAF1O14727 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APAF1O14727 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APAF1O14727 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APAF1O14727 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APAF1O14727 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APAF1O14727 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APAF1O14727 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APAF1O14727 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
APAF1O14727 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APAF1O14727 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APAF1O14727 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APAF1O14727 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APAF1O14727 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APAF1O14727 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APAF1O14727 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APAF1O14727 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APAF1O14727 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APAF1O14727 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APAF1O14727 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APAF1O14727 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APAF1O14727 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APAF1O14727 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APAF1O14727 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APAF1O14727 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APAF1O14727 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms