Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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PTPRTO14522 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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PTPRTO14522 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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PTPRTO14522 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRTO14522 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
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