Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GOLGA8SH3BPF8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms