Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms