Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf172C9J069 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms