Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVV-2B6SEH9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVV-2B6SEH9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms