Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00862A6NCI5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms