Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM89A2RUT3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms