Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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SNX13Q9Y5W8 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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SNX13Q9Y5W8 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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SNX13Q9Y5W8 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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SNX13Q9Y5W8 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX13Q9Y5W8 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX13Q9Y5W8 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX13Q9Y5W8 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX13Q9Y5W8 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX13Q9Y5W8 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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