Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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