Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

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Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SNX29Q8TEQ0 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SNX29Q8TEQ0 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SNX29Q8TEQ0 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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