Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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PTPROQ16827 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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PTPROQ16827 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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PTPROQ16827 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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