Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
FSCN1Q16658 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FSCN1Q16658 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms