Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
ZNHIT3Q15649 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ZNHIT3Q15649 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms