Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GPNMBQ14956 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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GPNMBQ14956 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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GPNMBQ14956 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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GPNMBQ14956 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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GPNMBQ14956 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GPNMBQ14956 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPNMBQ14956 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPNMBQ14956 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPNMBQ14956 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GPNMBQ14956 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
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