Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CKAP5Q14008 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
CKAP5Q14008 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms