Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GTF2H3Q13889 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms