Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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