Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTK7Q13308 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms