Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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TRAF1Q13077 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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TRAF1Q13077 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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TRAF1Q13077 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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TRAF1Q13077 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRAF1Q13077 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRAF1Q13077 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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TRAF1Q13077 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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TRAF1Q13077 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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