Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MKRN3Q13064 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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