Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIK3Q13003 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms