Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFIAQ12857 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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