Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
GDE1Q9NZC3 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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GDE1Q9NZC3 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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GDE1Q9NZC3 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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GDE1Q9NZC3 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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GDE1Q9NZC3 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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GDE1Q9NZC3 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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GDE1Q9NZC3 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
GDE1Q9NZC3 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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