Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TMOD3Q9NYL9 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms