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| CTXN3 | Q4LDR2 | AC244035.3-201 | ENST00000428399 | 271 nt | TSL 2 BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTCO2P11-201 | ENST00000431069 | 680 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL23AP30-201 | ENST00000432419 | 501 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC092573.2-201 | ENST00000434546 | 243 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC00278-202 | ENST00000444263 | 587 nt | TSL 3 BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC009237.8-201 | ENST00000445492 | 379 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC132479.1-201 | ENST00000449160 | 144 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | AC023194.1-201 | ENST00000493084 | 308 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | AP003718.1-201 | ENST00000529884 | 583 nt | TSL 4 BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC010546.1-201 | ENST00000569391 | 485 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL162713.1-201 | ENST00000604480 | 262 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Z84480.1-201 | ENST00000605131 | 311 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL359740.1-201 | ENST00000624340 | 592 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | hsa-mir-4776-1.1-201 | ENST00000636364 | 80 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR12D1-207 | ENST00000514827 | 1712 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | IL6ST-205 | ENST00000381294 | 2574 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CHM-205 | ENST00000615443 | 2821 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PHC3-215 | ENST00000495893 | 12666 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | STEAP4-202 | ENST00000380079 | 9988 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RAD17-202 | ENST00000305138 | 3164 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZBTB8OS-201 | ENST00000341885 | 312 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.3-201 | ENST00000362331 | 103 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC00862-202 | ENST00000367356 | 759 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TSHB-202 | ENST00000369517 | 474 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DEFB110-201 | ENST00000371148 | 384 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-641P-201 | ENST00000384006 | 107 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FGFR1OP2P1-201 | ENST00000395943 | 500 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS4XP3-201 | ENST00000398541 | 413 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Z99755.1-201 | ENST00000414048 | 380 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ATP13A5-AS1-201 | ENST00000414634 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTCO1P21-201 | ENST00000416634 | 589 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MED13P1-201 | ENST00000428342 | 171 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC073464.1-201 | ENST00000429823 | 534 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL359081.1-201 | ENST00000432083 | 615 nt | TSL 2 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TAAR7P-201 | ENST00000436141 | 242 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HMGB3P12-201 | ENST00000438745 | 556 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CYCSP32-201 | ENST00000440548 | 321 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NEFMP1-201 | ENST00000443423 | 1006 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC025428.1-201 | ENST00000444137 | 403 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL357552.1-201 | ENST00000445254 | 415 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CBWD4P-201 | ENST00000445695 | 655 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC079781.2-201 | ENST00000446424 | 169 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | GRM7-AS3-209 | ENST00000458713 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MCCC1-AS1-201 | ENST00000471731 | 765 nt | TSL 5 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC121764.1-201 | ENST00000472238 | 563 nt | TSL 4 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL21P13-201 | ENST00000488305 | 481 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC005920.2-201 | ENST00000509833 | 332 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC025475.1-201 | ENST00000512939 | 487 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02100-201 | ENST00000512978 | 238 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC108727.1-201 | ENST00000513802 | 393 nt | TSL 2 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-410P-201 | ENST00000517006 | 107 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | IGKV2-23-201 | ENST00000518729 | 323 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP006587.4-201 | ENST00000526053 | 529 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RGS5-206 | ENST00000527988 | 373 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC090531.1-202 | ENST00000548450 | 499 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SUB1P2-201 | ENST00000556401 | 297 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL360157.1-201 | ENST00000565962 | 87 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC099793.1-201 | ENST00000567538 | 285 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01905-202 | ENST00000588139 | 459 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC010928.1-202 | ENST00000589354 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC097467.3-205 | ENST00000597955 | 594 nt | TSL 5 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL022154.1-201 | ENST00000604698 | 785 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL160281.1-201 | ENST00000605307 | 311 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC007619.2-201 | ENST00000605743 | 379 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SMAD5-AS1_2.1-201 | ENST00000617906 | 131 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC006111.3-201 | ENST00000622137 | 383 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | C17orf112-201 | ENST00000623702 | 835 nt | TSL 2 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RTTN-201 | ENST00000255674 | 6960 nt | TSL 5 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ATXN3-248 | ENST00000558190 | 26812 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | TUG1-202 | ENST00000521091 | 2110 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | EVI2A-202 | ENST00000461237 | 1540 nt | APPRIS ALT2 TSL 4 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | VBP1-204 | ENST00000625964 | 1547 nt | TSL 5 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LRRC49-224 | ENST00000560691 | 2531 nt | TSL 2 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-960P-201 | ENST00000364056 | 120 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SMIM11P1-201 | ENST00000369586 | 178 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | IGLV5-37-201 | ENST00000390300 | 374 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU2-39P-201 | ENST00000410604 | 198 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | BTF3L4P3-201 | ENST00000418879 | 476 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC007919.1-201 | ENST00000429380 | 217 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL7P28-201 | ENST00000437739 | 740 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND1P34-201 | ENST00000438556 | 671 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC018643.1-201 | ENST00000445459 | 414 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL590664.1-201 | ENST00000448065 | 339 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL445465.2-201 | ENST00000455530 | 461 nt | TSL 2 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC123023.1-201 | ENST00000455974 | 555 nt | TSL 4 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC093206.1-201 | ENST00000515364 | 497 nt | TSL 3 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA70.19-201 | ENST00000516717 | 90 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FAM92A1P1-201 | ENST00000528023 | 890 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC008114.1-201 | ENST00000544122 | 427 nt | TSL 2 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS3AP4-201 | ENST00000555161 | 764 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |