Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CNPY1Q3B7I2 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CNPY1Q3B7I2 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms