Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms