Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTF1Q16619 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms