Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
VAMP3Q15836 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
VAMP3Q15836 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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