Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
LAPTM4AQ15012 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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