Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHPRHQ149N8 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SHPRHQ149N8 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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