Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
NFIXQ14938 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
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