Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CHD4Q14839 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms