Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SPTAN1Q13813 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
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