Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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SNTA1Q13424 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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SNTA1Q13424 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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SNTA1Q13424 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
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SNTA1Q13424 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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SNTA1Q13424 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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SNTA1Q13424 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SNTA1Q13424 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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