Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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