Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
CHAF1AQ13111 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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