Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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