Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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