Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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HOXD1Q9GZZ0 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HOXD1Q9GZZ0 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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