Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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TRERF1Q96PN7 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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TRERF1Q96PN7 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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TRERF1Q96PN7 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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TRERF1Q96PN7 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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TRERF1Q96PN7 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRERF1Q96PN7 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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