Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
UBXN4Q92575 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
UBXN4Q92575 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.9 ms