Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
EXT1Q16394 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms